Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP1P21291 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms