Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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