Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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