Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CETPP11597 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CETPP11597 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CETPP11597 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CETPP11597 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms