Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms