Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFLP07196 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFLP07196 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms