Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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