Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms