Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX6O95503 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX6O95503 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX6O95503 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX6O95503 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms