Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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