Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms