Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLGNO14967 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLGNO14967 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms