Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF10AO00220 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms