Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms