Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMM5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMM5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMM5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BMM5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BMM5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BMM5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3BMM5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3BMM5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3BMM5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3BMM5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms