Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms