Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E9PBE3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms