Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms