Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRBA1A5PL33 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms