Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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