Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms