Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms