Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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