Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms