Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms