Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms