Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP6Q9NYH9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms