Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKS1Q9NXB0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms