Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms