Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C11orf49Q9H6J7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms