Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms