Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC3Q9BY71 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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