Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms