Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms