Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM43Q9BTV4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TMEM43Q9BTV4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TMEM43Q9BTV4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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