Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HDHD3Q9BSH5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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