Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms