Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCZQ96LD1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms