Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms