Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN7L3BQ96GX2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms