Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms