Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms