Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms