Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms