Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NXNL1Q96CM4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms