Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC3Q96B67 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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