Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms