Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 LINC01358-209ENST00000635072 1114 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNKSR2Q8WXI2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 PRKG1-AS1-203ENST00000452247 886 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AL163195.2-203ENST00000553604 573 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNKSR2Q8WXI2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms