Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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