Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRFBP1Q8NEF9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms